Deep Research 【決定版】臨床疑問から統計手法を調査する方法まとめ(GPTs & Deep Research使用)
今回は、臨床疑問から統計手法を調査する一連の流れを解説します。臨床疑問～統計手法決定までの流れまずは、普段行っている臨床研究コンサルタント業務の流れを細分化してどの部分をAIに任せることができるかを考えてみます。おおまかには下記のような流れ...
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Cursor R初学者のCursor活用法：コードの解説機能
はじめにR初学者の方にとって、Rコードの意味を直感的に理解するのは難しいです。コードの意味が分からないときはChatGPTなどの生成AIに質問してみましょう。ほとんどの経験者より早く、詳細に解説してくれます。一方で、質問するとき・回答を適用...
AIエージェント 解析手順書で思い通りにAIエージェントを導こう
1. はじめに解析手順書の作成からAIに全任せした記事では、以下のように、解析手順書の作成から解析まで全てAIに任せしました。 臨床課題から解析手法の提案 解析手順書の作成 AIエージェントで自動解析 → 解析レポート作成 論文に記載するS...
Deep Research AIと始める臨床研究 その1: DeepResearchで臨床疑問→統計解析手法の調査
「臨床疑問に対して、どのように統計解析すればいいかわからない」と悩んだ経験はありませんか？そんな時はもちろん、身近な生物統計家の方に相談するのが一番です。しかし、気軽に相談できる専門家が身近にいるのはかなり恵まれている方だけでしょう。もし、...
データハンドリング Cursorでデータハンドリング実践（縦持ちデータ→生存時間解析）
今回は、AIドリブンなデータハンドリングの実践テクニックとして、時系列で収集したデータから、生存時間解析用のデータセットに変換する方法をご紹介します。使用するデータは、縦持ちデータのハンドリング記事で使用したサンプルデータです。いきなりです...
2値アウトカム 傾向スコアマッチング（2値アウトカム）
この記事を読んでできることこの記事では、CursorというAIエディタを用いてRを動かし傾向スコアマッチングと2値アウトカムのリスク差やオッズ比の推定を行う方法をご紹介します。具体的には、一切コードを書かずに論文用のTableを作成し、さら...
データハンドリング Cursorでデータハンドリング（縦持ちデータ）
この記事では、CursorのCommand K機能 (ctrl+K) を使って、コード上からAIに指示を出してデータハンドリングを進めていきます。この記事を読めば、データハンドリングにおけるAIへの指示の出し方が学べます。また、臨床研究で使...
データハンドリング Cursorでデータハンドリング（横持ちデータ）
この記事では、CursorのCommand K機能 (ctrl+K) を使って、コード上からAIに指示を出してデータハンドリングを進めていきます。この記事を読めば、データハンドリングにおけるAIへの指示の出し方が学べます。また、臨床研究で使...
Cursor Cursor×Quartoで解析レポートを作成
解析レポートの作成にはQuartoというドキュメント作成システムを使用します。Quartoとは、Markdown + R（+その他プログラミング言語）で動的レポーティングを行うためのツールです。 Markdownで記述された文書に、Rのコー...
Cursor RのPathを通す方法（Windows）
Pathを通すとは？ Pathを通すというのは、コンピュータがRプログラムを見つけられるようにする設定のことです。より具体的な説明 コンピュータには「PATH環境変数」という、プログラムを探す場所のリストがあります。 コマンドラインやターミ...